根據(jù)《財(cái)政部?商務(wù)部?稅務(wù)總局關(guān)于繼續(xù)執(zhí)行研發(fā)機(jī)構(gòu)采購(gòu)設(shè)備增值稅政策的公告》（2019年第91號(hào)，以下簡(jiǎn)稱91號(hào)公告）規(guī)定，稅務(wù)總局配套制發(fā)了《研發(fā)機(jī)構(gòu)采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備增值稅退稅管理辦法》（以下簡(jiǎn)稱《辦法》）?，F(xiàn)解讀如下：
一、《辦法》出臺(tái)的背景
為鼓勵(lì)科學(xué)研究和技術(shù)開發(fā)，減輕研發(fā)機(jī)構(gòu)研發(fā)成本，經(jīng)國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)，財(cái)政部會(huì)同商務(wù)部和稅務(wù)總局發(fā)布了91號(hào)公告，明確自2019年1月1日至2020年12月31日，繼續(xù)對(duì)研發(fā)機(jī)構(gòu)（包括內(nèi)資研發(fā)機(jī)構(gòu)和外資研發(fā)中心）采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備全額退還增值稅，并規(guī)定具體退稅管理辦法由稅務(wù)總局會(huì)同財(cái)政部制定。為落實(shí)91號(hào)公告，便于研發(fā)機(jī)構(gòu)辦理采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備退稅，經(jīng)商財(cái)政部，稅務(wù)總局出臺(tái)了《辦法》。
二、《辦法》的主要內(nèi)容解讀
（一）研發(fā)機(jī)構(gòu)和國(guó)產(chǎn)設(shè)備的具體范圍
辦理增值稅退稅的研發(fā)機(jī)構(gòu)和國(guó)產(chǎn)設(shè)備的具體范圍，按照91號(hào)公告第一條、第二條和第四條的規(guī)定執(zhí)行。
（二）研發(fā)機(jī)構(gòu)如何辦理采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備退稅備案
適用采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備退稅政策的研發(fā)機(jī)構(gòu)，應(yīng)于首次申報(bào)采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備增值稅退稅時(shí)辦理退稅備案手續(xù)。辦理手續(xù)時(shí)需要的相關(guān)資料包括研發(fā)機(jī)構(gòu)資質(zhì)證明資料、《出口退（免）稅備案表》等。需要提醒的是，《出口退（免）稅備案表》內(nèi)容填寫要真實(shí)、完整，其中，“企業(yè)類型”選擇“其他單位”，“出口退（免）稅管理類型”依據(jù)資質(zhì)證明材料填寫“內(nèi)資研發(fā)機(jī)構(gòu)（簡(jiǎn)寫：內(nèi)資機(jī)構(gòu)）”或“外資研發(fā)中心（簡(jiǎn)寫：外資中心）”，其他欄次按填表說(shuō)明填寫。
《辦法》下發(fā)前已辦理采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備退稅備案的研發(fā)機(jī)構(gòu)，無(wú)需再次辦理備案。
（三）研發(fā)機(jī)構(gòu)如何辦理采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備退稅備案的變更和撤回
1.如何辦理備案變更。已辦理備案的研發(fā)機(jī)構(gòu)，《出口退（免）稅備案表》中內(nèi)容發(fā)生變更的，須自變更之日起30日內(nèi)，持相關(guān)資料向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理備案變更。
2.如何辦理撤回。研發(fā)機(jī)構(gòu)發(fā)生解散、破產(chǎn)、撤銷以及其他依法應(yīng)終止采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備退稅事項(xiàng)的，應(yīng)持相關(guān)資料向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理備案撤回。主管稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)按規(guī)定結(jié)清退稅款后，辦理備案撤回。外資研發(fā)中心在退稅資格復(fù)審前，因自身?xiàng)l件發(fā)生變化，已不符合研發(fā)機(jī)構(gòu)的條件，應(yīng)自條件變化之日起30日內(nèi)辦理退稅備案撤回。
（四）研發(fā)機(jī)構(gòu)如何進(jìn)行退稅申報(bào)
研發(fā)機(jī)構(gòu)申報(bào)采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備退稅時(shí)，需提交《購(gòu)進(jìn)自用貨物退稅申報(bào)表》、采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備合同、增值稅專用發(fā)票或者增值稅普通發(fā)票等資料?？赊k理的退稅額，為增值稅發(fā)票上注明的稅額。
上述增值稅發(fā)票的具體要求：1.增值稅專用發(fā)票，在增值稅發(fā)票綜合服務(wù)平臺(tái)上線后，應(yīng)當(dāng)已通過(guò)增值稅發(fā)票綜合服務(wù)平臺(tái)確認(rèn)用途為“用于出口退稅”；在增值稅發(fā)票綜合服務(wù)平臺(tái)上線前，應(yīng)當(dāng)已經(jīng)掃描認(rèn)證通過(guò)，或者已通過(guò)增值稅發(fā)票選擇確認(rèn)平臺(tái)勾選確認(rèn)。2.增值稅普通發(fā)票，為開具時(shí)間為2019年1月1日至本公告發(fā)布之日前的增值稅普通發(fā)票[不含增值稅普通發(fā)票(卷票）]。
研發(fā)機(jī)構(gòu)采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備取得的增值稅專用發(fā)票，已用于進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣的，不得申報(bào)退稅；已用于退稅的，不得用于進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣。
（五）研發(fā)機(jī)構(gòu)辦理退稅的申報(bào)期限
研發(fā)機(jī)構(gòu)采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備退稅的申報(bào)期限，為采購(gòu)之日次月起至次年4月30日前的各增值稅納稅申報(bào)期?？紤]到新冠肺炎疫情影響，2019年采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備退稅的申報(bào)期限，延長(zhǎng)至2020年8月31日前的各增值稅納稅申報(bào)期。
如果研發(fā)機(jī)構(gòu)未能在規(guī)定的期限內(nèi)申報(bào)退稅，根據(jù)《財(cái)政部?稅務(wù)總局關(guān)于明確國(guó)有農(nóng)用地出租等增值稅政策的公告》（2020年第2號(hào)）的規(guī)定，待研發(fā)機(jī)構(gòu)收齊憑證及信息后，仍可繼續(xù)申報(bào)辦理退稅。
（六）稅務(wù)機(jī)關(guān)如何審核辦理退稅
如果研發(fā)機(jī)構(gòu)屬于增值稅一般納稅人，稅務(wù)機(jī)關(guān)經(jīng)審核符合規(guī)定的，應(yīng)按規(guī)定辦理退稅。如果研發(fā)機(jī)構(gòu)不是增值稅一般納稅人，或者雖然是增值稅一般納稅人、但使用增值稅普通發(fā)票申報(bào)退稅的，稅務(wù)機(jī)關(guān)須確認(rèn)發(fā)票真實(shí)、發(fā)票所列設(shè)備已申報(bào)納稅后，方能辦理退稅。
（七）已退稅的國(guó)產(chǎn)設(shè)備轉(zhuǎn)移或移作他用如何處理
已辦理增值稅退稅的國(guó)產(chǎn)設(shè)備，自增值稅發(fā)票開具之日起3年內(nèi)，設(shè)備所有權(quán)轉(zhuǎn)移或移作他用的，研發(fā)機(jī)構(gòu)須按照規(guī)定向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)補(bǔ)繳已退稅款。補(bǔ)繳已退稅款按以下方法計(jì)算：
應(yīng)補(bǔ)繳稅款＝增值稅發(fā)票上注明的稅額×（設(shè)備折余價(jià)值÷設(shè)備原值）
設(shè)備折余價(jià)值＝增值稅發(fā)票上注明的金額-累計(jì)已提折舊????
累計(jì)已提折舊按照企業(yè)所得稅法的有關(guān)規(guī)定計(jì)算。
（八）違法違規(guī)的處理
如果研發(fā)機(jī)構(gòu)騙取采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備增值稅退稅的，主管稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)追回已退稅款，并依照稅收征管法的有關(guān)規(guī)定處理。如果研發(fā)機(jī)構(gòu)涉及重大稅收違法失信案件被依法公布信息的，研發(fā)機(jī)構(gòu)將停止享受采購(gòu)國(guó)產(chǎn)設(shè)備退稅政策，并應(yīng)及時(shí)辦理退稅備案撤回。
三、執(zhí)行期限
根據(jù)91號(hào)公告規(guī)定，《辦法》的施行期限為2019年1月1日至2020年12月31日，以增值稅發(fā)票的開具日期為準(zhǔn)。
